Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr4P51680 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr4P51680 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr4P51680 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr4P51680 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr4P51680 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr4P51680 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr4P51680 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr4P51680 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr4P51680 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr4P51680 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr4P51680 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms