Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd7P50283 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd7P50283 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms