Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms