Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfbP49766 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfbP49766 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfbP49766 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfbP49766 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfbP49766 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfbP49766 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfbP49766 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfbP49766 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VegfbP49766 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VegfbP49766 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VegfbP49766 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VegfbP49766 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VegfbP49766 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 361.8 ms