Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CitP49025 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CitP49025 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CitP49025 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CitP49025 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CitP49025 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CitP49025 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CitP49025 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CitP49025 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CitP49025 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CitP49025 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CitP49025 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CitP49025 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CitP49025 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CitP49025 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CitP49025 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CitP49025 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CitP49025 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CitP49025 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CitP49025 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CitP49025 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CitP49025 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CitP49025 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CitP49025 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CitP49025 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CitP49025 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CitP49025 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CitP49025 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CitP49025 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CitP49025 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CitP49025 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CitP49025 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CitP49025 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CitP49025 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CitP49025 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CitP49025 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CitP49025 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CitP49025 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CitP49025 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CitP49025 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CitP49025 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CitP49025 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CitP49025 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CitP49025 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CitP49025 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CitP49025 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CitP49025 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CitP49025 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CitP49025 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CitP49025 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CitP49025 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CitP49025 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms