Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms