Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms