Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax9P47242 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms