Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax7P47239 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax7P47239 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms