Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms