Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms