Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms