Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms