Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox6P40645 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox6P40645 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox6P40645 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms