Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csf3rP40223 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms