Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik2P39087 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik2P39087 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik2P39087 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik2P39087 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik2P39087 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik2P39087 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik2P39087 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms