Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtlP38585 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtlP38585 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtlP38585 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtlP38585 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtlP38585 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtlP38585 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtlP38585 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtlP38585 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtlP38585 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtlP38585 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtlP38585 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtlP38585 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtlP38585 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtlP38585 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtlP38585 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtlP38585 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtlP38585 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtlP38585 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtlP38585 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtlP38585 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtlP38585 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtlP38585 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TtlP38585 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtlP38585 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtlP38585 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtlP38585 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtlP38585 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtlP38585 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtlP38585 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtlP38585 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtlP38585 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtlP38585 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtlP38585 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtlP38585 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtlP38585 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtlP38585 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtlP38585 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TtlP38585 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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