Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig1P37913 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig1P37913 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lig1P37913 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms