Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprkP35822 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprkP35822 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprkP35822 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprkP35822 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprkP35822 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprkP35822 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprkP35822 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprkP35822 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprkP35822 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprkP35822 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprkP35822 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms