Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms