Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp12P34960 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms