Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms