Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd28P31041 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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