Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msr1P30204 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msr1P30204 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msr1P30204 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msr1P30204 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms