Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OatP29758 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OatP29758 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OatP29758 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OatP29758 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OatP29758 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OatP29758 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OatP29758 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OatP29758 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OatP29758 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OatP29758 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OatP29758 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OatP29758 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OatP29758 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OatP29758 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OatP29758 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OatP29758 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OatP29758 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OatP29758 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OatP29758 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OatP29758 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OatP29758 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OatP29758 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OatP29758 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OatP29758 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OatP29758 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OatP29758 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OatP29758 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OatP29758 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OatP29758 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OatP29758 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OatP29758 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OatP29758 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OatP29758 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OatP29758 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OatP29758 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OatP29758 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OatP29758 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OatP29758 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OatP29758 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OatP29758 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OatP29758 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OatP29758 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OatP29758 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OatP29758 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OatP29758 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OatP29758 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OatP29758 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OatP29758 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OatP29758 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OatP29758 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OatP29758 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OatP29758 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OatP29758 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OatP29758 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OatP29758 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OatP29758 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OatP29758 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OatP29758 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OatP29758 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OatP29758 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OatP29758 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OatP29758 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
OatP29758 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OatP29758 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OatP29758 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OatP29758 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms