Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif5cP28738 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kif5cP28738 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms