Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf1P28659 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf1P28659 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf1P28659 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf1P28659 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf1P28659 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf1P28659 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf1P28659 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf1P28659 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf1P28659 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf1P28659 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf1P28659 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf1P28659 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf1P28659 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf1P28659 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf1P28659 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf1P28659 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf1P28659 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf1P28659 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf1P28659 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms