Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col2a1P28481 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms