Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tsta3P23591 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms