Protein–RNA interactions for Protein: P21761

Trhr, Thyrotropin-releasing hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhrP21761 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrhrP21761 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrhrP21761 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrhrP21761 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrhrP21761 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrhrP21761 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrhrP21761 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrhrP21761 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TrhrP21761 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrhrP21761 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms