Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TP20293 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TP20293 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TP20293 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TP20293 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TP20293 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TP20293 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TP20293 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TP20293 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP20293 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP20293 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP20293 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP20293 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP20293 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP20293 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP20293 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP20293 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP20293 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP20293 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP20293 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP20293 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP20293 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP20293 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP20293 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP20293 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP20293 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP20293 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP20293 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TP20293 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP20293 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP20293 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP20293 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP20293 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP20293 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP20293 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TP20293 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TP20293 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP20293 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TP20293 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP20293 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP20293 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP20293 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TP20293 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms