Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms