Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18529 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18529 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18529 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18529 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18529 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18529 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18529 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18529 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18529 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms