Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LdhbP16125 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LdhbP16125 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LdhbP16125 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LdhbP16125 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LdhbP16125 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms