Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms