Protein–RNA interactions for Protein: P13541

Myh3, Myosin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh3P13541 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh3P13541 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh3P13541 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh3P13541 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh3P13541 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh3P13541 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh3P13541 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms