Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn1P12960 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn1P12960 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms