Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spp1P10923 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spp1P10923 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spp1P10923 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spp1P10923 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spp1P10923 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms