Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms