Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd3P09027 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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