Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxb7P09024 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms