Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms