Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms