Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col3a1P08121 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms