Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01663 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01663 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01663 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01663 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01663 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01663 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01663 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01663 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01663 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01663 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01663 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01663 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01663 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01663 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01663 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01663 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01663 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01663 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01663 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01663 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01663 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01663 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01663 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01663 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01663 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01663 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01663 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01663 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01663 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01663 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01663 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01663 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01663 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01663 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01663 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01663 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01663 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01663 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01663 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01663 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01663 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms