Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01662 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01662 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01662 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01662 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01662 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01662 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01662 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01662 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01662 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01662 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01662 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01662 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01662 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01662 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01662 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01662 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01662 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01662 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01662 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01662 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01662 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01662 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01662 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01662 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01662 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01662 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01662 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01662 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01662 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01662 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01662 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01662 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01662 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01662 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01662 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01662 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01662 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01662 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01662 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01662 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01662 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01662 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms