Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01660 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01660 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01660 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01660 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01660 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01660 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01660 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01660 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01660 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01660 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01660 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01660 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01660 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01660 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01660 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01660 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01660 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01660 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01660 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01660 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms