Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01656 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01656 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01656 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01656 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01656 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01656 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01656 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01656 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01656 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01656 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P01656 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01656 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01656 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01656 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01656 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01656 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01656 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P01656 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01656 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01656 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01656 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01656 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01656 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01656 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01656 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01656 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01656 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01656 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01656 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01656 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
P01656 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01656 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01656 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01656 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01656 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01656 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01656 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01656 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01656 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01656 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01656 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01656 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01656 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01656 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01656 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01656 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01656 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01656 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01656 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01656 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01656 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01656 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01656 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01656 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01656 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01656 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01656 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01656 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01656 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01656 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01656 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01656 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01656 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01656 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01656 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01656 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms