Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sp1O89090 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sp1O89090 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sp1O89090 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp1O89090 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp1O89090 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sp1O89090 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp1O89090 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp1O89090 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms