Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AfmO89020 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AfmO89020 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AfmO89020 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AfmO89020 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AfmO89020 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AfmO89020 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AfmO89020 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AfmO89020 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AfmO89020 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AfmO89020 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AfmO89020 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AfmO89020 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AfmO89020 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AfmO89020 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AfmO89020 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AfmO89020 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AfmO89020 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AfmO89020 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
AfmO89020 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AfmO89020 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AfmO89020 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AfmO89020 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AfmO89020 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AfmO89020 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
AfmO89020 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AfmO89020 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AfmO89020 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AfmO89020 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AfmO89020 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AfmO89020 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AfmO89020 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AfmO89020 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AfmO89020 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AfmO89020 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AfmO89020 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AfmO89020 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AfmO89020 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AfmO89020 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AfmO89020 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AfmO89020 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AfmO89020 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AfmO89020 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AfmO89020 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AfmO89020 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AfmO89020 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AfmO89020 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AfmO89020 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AfmO89020 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AfmO89020 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AfmO89020 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AfmO89020 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms